宽永十五年，德川幕府对天主教徒施加严厉打压，最终引发了一场血腥而残酷的岛原之乱。在这场冲突中，约两万名天主教徒遭受了惨无人道的屠杀。夜幕降临，满怀仇恨的教徒首领天草四郎时贞（由沢田研二饰演）复活于世，他背弃了信仰，转生为魔界生物，并立誓要向幕府的统治者复仇。随后，他开始召唤细川夫人（由佳那晃子饰演）的怨灵、濒临死亡但仍心存遗憾的剑圣宫本武藏（由緒形拳饰演）、宝藏院胤舜（由室田日出男饰演），以及遭遇灭族的伊贺忍者雾丸（由真田広之饰演）加入他的魔界大军，邪恶势力迅速增强。细川夫人化身为阿玉，试图迷惑四代将军家纲（由松橋登饰演），而柳生但马守宗矩（由若山富三郎饰演）虽然有心除魔，却在命运的捉弄下，在临终之际堕入魔道。柳生十兵卫（由千葉真一饰演）则成为了对抗邪恶力量的最后一线希望……gt