日本警视厅特殊部队（SIT）的小队长濑文焚流（由加濑亮饰演），在一次执行任务时目睹队友离奇死亡，面对高层质疑时无从辩解。最终，他被调往公安部公安第五课——不明事件调查科，这个部门专门处理一些难以理解的超自然案件。在现代社会中，科学发达，这也让第五课成为一个难以被外界认可的边缘机构。除了濑文，团队内还有机灵滑头的上司野野村光太郎和智商高达201的怪异少女当麻纱绫（户田惠梨香饰）。在这段时间里，各种拥有超能力（SPEC）的奇异人物陆续出现，包括预言师和“神之手”等。随着濑文与当麻共同调查案件，他逐渐踏入了一个鲜为人知、隐秘重重的阴谋世界……gt